数据分析

烈冰科技凭借丰富的数据分析经验,开发了数十条自动化分析流程和上百个数据分析功能task,采用并行计算和hadoop框架,实现一键高效分析。

定制流程
平台可进行标准流程分析和定制化流程分析。标准流程分析可以实现一键式生成结果;定制化流程分析可根据不同研究需要自定义参数及分析任务,简单高效地满足用户的科研需求。 平台中内预设多条分析pipeline,如全基因组测序,转录组测序,miRNA测序,circRNA测序,lncRNA测序,甲基化测序,ChIP-Seq以及芯片分析等,便于用户开展分析。
项目管理
项目管理对项目状态进行细分,分为前期、后期、结项等阶段。用户能够直观查看项目状态,且能对项目运行情况,如运行时间、负责人员等进行跟踪和管理。同时,管理员可以设置每个人员权限控制,分为负责、参与、观看,方便项目人员进行协同工作,既保证数据安全又能很好的保持高效协作。
任务监控
任务监控帮助用户实时监控CPU的使用率以及内存使用量,用户可以清晰知道各个任务所占用CPU、内存,并实时展示任务日志,方便用户了解分析进度。项目运行中出现错误,也会自动通过邮件或短信及时向用户报警。 同时集群监控系统可以实时进行监控集群的计算负载和IO负载,并设有硬件监控报警,如某一硬盘有坏道时,会报警提示更换硬盘。
基因组浏览器
数据可视化是数据分析的一个重要组成部分,NovelBrain整合了可交互的基因组浏览器,可以使用户便捷地查看突变位点的具体信息。 即使数据存储在云端,用户也可以异地查看测序数据比对情况或SNP相关信息。帮助用户快速确认突变情况并作出决策。
数据库
为了支持全面而准确的数据分析,NovelBrain整合了大量权威数据库。 如NCBI,EMBL, UniProtKB/Swiss-Prot ,OMIM,SNPdb,DrugBank以及GO,KEGG PATHWAY等收费版数据库, 还包括小鼠数据库MGI,水稻数据库RAP-DB、IRGSP,拟南芥TAIR数据库,人类的千人基因组HapMap,肿瘤数据库TCGA等等。 方便用户对基因进行查询、注释、以及进行深入分析。
行业动态
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